河海大学本科专业的标准学制为4年。学生根据录取专业分年级在相应校区就读，学业合格者颁发河海大学本科毕业证书；符合学位授予条件，授予相应学科门类学士学位。
河海大学是以水利为特色，工科为主，多学科协调发展的教育部直属全国重点大学，是国家“双一流”建设、“211工程”重点建设、“985工程优势学科创新平台”建设以及经国家批准设立研究生院的高校。其特色专业包括：
| 序号 | 国家特色专业 | 专业方向 | 入选批次 |
|---|---|---|---|
| 1 | 水利水电工程 | 水利工程 | 第一批 |
| 2 | 水文与水资源工程 | 水利工程 | 第一批 |
| 3 | 港口航道与海岸工程 | 水利工程 | 第一批 |
| 4 | 土木工程 | 第二批 | |
| 5 | 环境工程 | 第二批 | |
| 6 | 计算机科学与技术 | 第三批 | |
| 7 | 电气工程及其自动化 | 第三批 | |
| 8 | 热能与动力工程 | 第四批 | |
| 9 | 工程力学 | 第四批 | |
| 10 | 通信工程 | 第六批 | |
| 11 | 农业水利工程 | 第六批 | |
| 12 | 新能源科学与工程 | 新能源 | 第七批 |
| 13 | 物联网工程 | 新一代信息技术 | 第七批 |
这些特色专业在各自领域具有较强的师资力量和科研实力，为学生提供了丰富的教学资源和实践机会。例如，港口航道与海岸工程专业是在全国范围内专业创办最早、培养学生最多的办学点，该专业先后入选江苏省品牌专业、首批国家特色专业、教育部卓越工程师教育培养计划，国家级一流本科专业建设点，江苏省国际化人才培养品牌专业和江苏省产教融合型品牌专业，在全国港航专业中率先通过了六年期工程教育专业认证。
