两者最大的区别是一个是细胞学检查，可以检查现在是否有发生癌变或者癌前病变；而另一个是病毒检查，HPV持续阳性可能会引发宫颈癌。
TCT检查是宫颈的液基细胞学检查，是目前国际上应用最广泛的宫颈病变筛查技术。
进行TCT检查时，使用专用的宫颈刷，刷取宫颈表面以及宫颈管内的脱落细胞，然后通过全自动细胞制备技术，将细胞进行制片、染色及观察。通过TCT技术，可以100%发现宫颈癌，并且可以发现部分宫颈癌前病变，以及霉菌、滴虫、病毒、衣原体等感染。
因为宫颈癌的发生首先是细胞层面的变化，通过TCT的细胞学筛查，可以最先在细胞层面上发现变化，使早期的宫颈癌筛查率大大提高。与传统的巴氏涂片法相比，宫颈癌的检出率提高了百分之二十以上。针对这部分通过筛查发现的早期宫颈癌，经过治疗后可以取得很好的治疗效果。甚至有一部分有生育要求的女性，可以采取保留子宫治疗，手术后仍然可以保留生育能力。
HPV是一种病毒，近年来的研究发现99%的宫颈癌患者都存在着HPV感染。
虽然说HPV感染可能导致宫颈癌的发生，但是处于生育年龄的女性本身都是HPV病毒的易感染体质，只不过有大概80%的人可以在感染后1-2年内将病毒自行清除，并不会导致宫颈癌变。如果只是单纯的发现HPV感染，还需要进一步做TCT细胞学检测。只有当HPV病毒感染同时合并有细胞学变化时，才需要进一步明确是否存在宫颈癌或癌前病变。如果只是单纯的HPV感染，细胞学无改变，那不需要紧张，定期复查就可以了。
TCT检查和HPV检查两者都可以作为宫颈癌的筛查方法，但是不推荐单独进行HPV筛查。由于30岁前（尤其是25岁以前）的女性HPV感染自然清除率比较高，为了减少不必要的恐慌，可以从30岁以后再进行HPV和TCT的联合筛查，30岁前单独进行TCT筛查就可以了。
